1、种子原因
（1）种子发芽率低：种子发芽率低会造成出苗不全。
（2）种子活力差：种子发芽率较高，但活力差，在低温的情况下也会影响出苗，导致出苗不全。
（3）陈种子：玉米种子一般可贮藏3-5年，贮藏年限越长发芽率下降越厉害，尤其是贮藏条件差的情况下发芽率下降得更快。另外，种子活力下降速度比发芽率还要快，有时发芽率高但活力不一定高，所以陈种子也易导致缺苗。
2、整地质量差
根茬、秸秆、地膜都会影响出全苗。另外，坷拉、石块，整地不平也会影响出苗。
3、土壤墒情不均匀、过大或过小
土壤底墒不均匀会导致墒情较好的地段出苗，而墒情较差的地段不出苗。
土壤墒情不足，大粒种子不易吸水出苗，小粒种子吸水少相对好出苗。当田间的墒情过大，土壤中的水分过多，比如播种以后，遇到了连续的降雨天气，再加上排水不良，种子的正常呼吸受阻，最终会影响发芽和出苗。
4、气温原因
有些农户为了赶墒播种，会忽略了当地的温度，如果温度过低，比如地温低于10度时，就会很大可能影响种子的发芽，导致不出苗。
一般玉米播种需要5-10厘米的土壤耕层温度稳定通过9-10摄氏度时才可以播种，如果播种时温度低于这个水平，就会导致种子萌发困难，如果低温持续时间较长，会出现“粉籽儿”现象，就是种子坏掉了，发不了芽，也会造成出苗不全的问题。
5、播种质量差
新手播种、老播种机，常会出现落粒不均匀，甚至相对较低地段不落粒的情况。
一般玉米播种多采用机械精量点播，播种深度镇压后达到3-4厘米为宜，如果播种过深、过浅，或者播种后没及时镇压，也会导致玉米出苗不全。
6、播种偏早
由于播种偏早，出苗后易遭受晚霜，出现霜冻，影响全苗。
7、种肥施用不当
种肥施用不当的原因，由于施种肥时，尿素用量偏大，尿素做种肥时不宜超过5-6公斤/每亩，用量过大会影响出苗；还有就是施用尿素作种肥时，与种子距离小于5厘米，造成烧芽的现象，导致出苗不全。
8、地下害虫
危害玉米的地下害虫主要是金针虫、地老虎、蛴螬、蝼蛄等。这些害虫主要以幼虫取食玉米的种子、根、幼苗等部位，造成缺苗。有些地块地下害虫比较严重，再加上播前没有使用拌种剂，导致玉米种被地下害虫啃食，一旦种子受损后，必然影响出苗。
9、盐碱地
盐碱较重地块，耐盐碱性较差的品种，常出现死芽现象，影响正常出苗。
10、除草剂
除草剂使用不当或除草剂残留都有可能影响玉米正常出苗。一些农户在玉米播种以后，会选择喷施苗前封闭除草剂来防治杂草，但是，如果封闭除草剂使用过量，或者使用时间过晚的话，很大可能造成除草剂药害，影响玉米出苗。
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